R:Оформление кода — различия между версиями

Версия 06:48, 20 февраля 2014

	Материал «R:Оформление кода», созданный автором Артём Клевцов, публикуется на условиях лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.
	Вы можете свободно: делиться произведением – копировать, распространять и передавать данное произведение. создавать производные – переделывать данное произведение. При соблюдении следующих условий: указание авторства - Вы должны указывать авторство (источник) данного произведения в виде, установленном автором или лицензиаром (но ни в коем случае не таким образом, который наводит на мысль, что автор поддерживает вас или ваше использование данного произведения). http://creativecommons.org/licenses/by/4.0 CC-BY-4.0 Creative Commons Attribution 4.0 true true

При совместной работе группы людей над одним проектом часто возникает необходимость в неких общих правилах оформления кода. Целью принятия и использования таких правил является упрощение восприятия программного кода человеком, минимизация нагрузки на память и зрение при чтении его чтении.

К сожалению, для языка R нет чётких правил оформления кода. В качестве источников таких правил обычно используется исходный код ядра R, в котором, правда, наблюдается весьма разнородные варианты оформления. Дополнительными источниками являются стандарты оформления кода, заимствованные из других языков программирования.

Одним из общих правил является необходимость придерживаться одного стиля в рамках одного проекта всего проекта.

Названия файлов

Прежде всего, названия файлов должны быть осмысленными и понятными.

Общим требования к именованию файлов является написания расширений файлов, включающего принадлежность к языку программирования R с большой буквы. Обратим внимание, что все UNIX-like операционные системы чувствительны к регистру в названиях файлов. Например: pulse-analyse.R, report.Rmw, presentation.Rmd. Бинарный формат хранения данных имеет расширение .RData.

Имена файлов содержат символы в нижнем регистре.

Для замены пробелов в названиях файлов обычно используются дефисы или нижние подчёркивания.

Названия функций и переменных

Существуют различные подходы к именованию функций и переменных. Но все они содержат общие рекомендации:

• Названия должны быть понятны и осмысленны: colMeans, read.table;
• Названия не должны быть слишком длинными или слишком короткими, что могли бы затруднить их понимание или восприятие;
• Не использовать имена уже используются в R или популярных пакетах. Для проверки уже используемых имён можно использовать функции find() и apropos();

Можно выделить несколько подходов к именованию функций и переменных:

• alllowercase (слитное написание, все символы в нижнем регистре, без разделителей). Широко используется в MATLAB. Примеры: searchpaths, searchpaths;
• period.separated (все символы в нижнем регистре с разделителями в виде точек). Используется только в R. Примеры: as.numeric, read.table, data.frame;
• underscore_separated (все символы в нижнем регистре с разделителями в виде нижних подчёркиваний). Используется дл именования переменных и функций в C++, Perl, Ruby. Примеры: package_version, seq_along;
• lowerCamelCase (слитное написание, первый символ в нижнем регистре, начало каждого составного слова в верхнем регистре). Используется во многих языках программирования. Примеры: colMeans, suppressPackageStartupMessage.;
• UpperCamelCase (слитное написание, первый символ в верхнем регистре, начало каждого составного слова в верхнем регистре). Используется во многих языках программирования. Примеры: Vectorize, NextMethod;

В различных руководствах приводятся разные рекомендации. Как мы уже отмечали, гораздо более важно придерживаться единого стиля при написании кода. В исходном коде R преимущественно используются стили lowerCamelCase, period.separated и underscore_separated. При этом period.separated, как уже отмечалось выше, используется в основном для создания функций для обработки S3 классов.

Присвоение

Для присвоения используется «<-» или «->», но не «=», который используется только для указания значений аргументов функций.

Отступы

Для отступов могут использоваться как пробелы, так и табуляция. В R coding standards рекомендуется использовать 4 пробела для кода и 2 пробела для документации. В Google's R Style Guide рекомендуется использоваться 2 пробела. Важно, чтобы отступы были везде одинаковыми, т.е. только пробелы или только табуляция.

Расстановка пробелов

Пробелы ставятся до и после математических символов и бинарных или логических операторов:

• математические символы: «=», «+», «-», «*», «/»;
• операторы присвоения: «<-», «->»;
• бинарные операторы: «%in%», «%%», «%/%»;
• логические операторы: «==», «!=», «&», «|», «<», «>», «<=», «>=».

Пробелы также ставятся после запятых.

Пробелы ставятся перед открывающейся фигурной скобкой - «{».

Пробелы ставятся перед открывающейся круглой скобкой - «(», за исключением объявления или вызова функции.

Пробелы также не ставятся между круглыми скобками:

Более корректно:

Рекомендуется отделять пробелами оператор присвоения значений аргументов:

Более корректно:

Общая логика и порядок написания скриптов

1. Комментарий, содержащий информацию о лицензии, под которой распространяется код;
2. Комментарий, содержащий информацию об авторе;
3. Комментарий, содержащий информацию о содержании и назначении скрипта;
4. Импорт пакетов и скриптов - вызов library() и source();
5. Объявления функций:
6. Выполнение основный выражений.

Ссылки

• R Style. An Rchaeological Commentary - http://cran.r-project.org/web/packages/rockchalk/vignettes/Rstyle.pdf
• Google's R Style Guide - http://google-styleguide.googlecode.com/svn/trunk/Rguide.xml
• Style guide - http://adv-r.had.co.nz/Style.html
• The State of Naming Conventions in R - http://journal.r-project.org/archive/2012-2/RJournal_2012-2_Baaaath.pdf
• R Coding Conventions (RCC) - http://www.aroma-project.org/developers/RCC